Darvina muzeja kolekcijas, kā arī pats muzejs nekad nevarētu pastāvēt, ja ne Aleksandrs Fedorovičs Kots, kuram kopš bērnības patika zooloģija, kolekcionēšana un īpaša interese par visu dzīvo. Būdams biologs, 19 gadu vecumā (1899) devās uz Sibīriju, kur savāca putnu izbāzeņu kolekciju, kas viņam atnesa medaļu vienā no Viskrievijas biedrībām izstādē.
Turpmāk jaunietis sadarbojās ar slaveno taksidermistu F. Lorencu, kur saņēma algu ar tiem pašiem izbāzeņiem (kas veidoja viņa mājas kolekcijas pamatu), mācījās universitātē, apmeklēja ārzemju muzejus, kur iepazinās ar Darvina teoriju, lasīja lekcijas par anatomiju Maskavas Augstākajos sieviešu kursos, uz kuriem pārcēlās privātkolekcija (1907). Līdz 1964. gadam A. Kots bija pastāvīgais direktors Kolekcijā, kas pārdzīvoja revolūcijas un karus, bet tikai 1995. gadā tika atvēlēta pieklājīga telpa Darvina muzejam.uz st. Vavilovs (57. māja).
Šodien izstādes un ekspozīcijas notiek galvenajā ēkā un izstāžu kompleksa ēkā. Atsevišķi aprīkotas telpas apmeklētājiem ar kustību traucējumiem, nedzirdīgiem, vājdzirdīgiem, vājredzīgiem un neredzīgiem cilvēkiem; ir rampas, lifti un lifti, kas padara apmeklējumu patīkamu un ērtu visu kategoriju iedzīvotājiem. Darvina paleontoloģijas muzejs saviem viesiem piedāvā plašu un interesantu programmu, tai skaitā radošo kolektīvu priekšnesumus, ekskursijas zālēs ar putnu balsis atveidotu aprīkojumu, demonstrē kustīgus dinozauru modeļus, parāda, kā dzīvība rit pilnā sparā zemūdens vulkānos u.c.
Jaunie Darvina muzeja apmeklētāji var reģistrēties jauno biologu kursos vai apmeklēt mākslas studiju un meistarklases, turklāt muzejs var iegādāties abonementus programmu apmeklēšanai, tostarp dažādu kultūras iestāžu apmeklējumam Maskavā. Vecākus bērnus varētu interesēt video tūres par senajiem putniem, evolūciju, aizvēsturiskajām pasaulēm, arī 3D formātā. Zooģeogrāfijas zālēs var aplūkot brīnišķīgi izgatavotus dzīvnieku izbāzeņus no dažādām pasaules malām, kas tiek prezentēti to dabiskajai dzīvotnei līdzīgās ainavās. Uz sienām ir dzīvnieku kažokādu paraugi, kurus varat glaudīt. Mikroevolūcijas ekspozīcijā interaktīvā ierīcē var mēģināt “samontēt” putnu no dažādām daļām, kas, pareizi izpildot uzdevumu, dziedās savu dziesmu.
Diezgan biežiDarvina muzeja durvis apmeklētājiem ir atvērtas bez maksas. Parasti tas notiek Jaungada brīvdienās vai dienās, kad var apmeklēt atsevišķas ekspozīcijas. Piemēram, gaismas un mūzikas izrāde "Dzīvā planēta" ir skatāma brīvdienās, bet tūre "Dzīves daudzveidība" otrdienās - piektdienās no plkst.16.00, kā arī brīvdienās un svētku dienās plkst.12.00 un 16.30.
Darvina Zooloģijas muzejā Maskavā tiek rīkotas brīvdienas, kas veltītas kādam konkrētam notikumam, tostarp: Ģimenes diena, Zemes diena, Putnu diena, Jaunā ekologa diena, Mātes diena vai pat Lešijas diena (etno svētki). Muzeju iespējams apmeklēt arī naktī (18. maijā) vai pieteikt dzimšanas dienas svinības bērnu grupai (ietver plašu ekskursiju un tēju bērnu istabā). Uz šādu pasākumu var tikt aicināti paši bērni (līdz 16 gadiem) un bērni kopā ar pieaugušajiem (grupas ne vairāk kā 20-35 cilvēki).